أثارت مجزرة خان شيخون الجدل بشأن حجم الترسانة الكيميائية التي ما زال يحتفظ بها نظام الأسد. وبهذا التجاوز للمعاهدة وارتكاب مزيد من المجازر تطرح أسئلة عن تفعيل آلية التحقيق في هذه المجازر لإدانة النظام ومحاسبته وفق القانون الدولي.