La Federación de Cooperativas Agropecuarias de San Juan (FECOAGRO) reúne a unas 25 cooperativas y más de 500 familias productoras que cultivan alrededor de 70 variedades de semillas agroecológicas. Tras la desaparición del programa ProHuerta, que absorbía el 90% de su producción, reorganizó su esquema comercial para seguir abasteciendo a municipios, instituciones y productores de todo el país.